Enigma Virtual Box è usato per la virtualizzazione di file system e registro di sistema e consente di consolidare tutti i file e chiavi di registro utilizzate dall'applicazione in un unico file eseguibile senza dover estrarre file virtuali sul disco. Con Enigma Virtual Box, è possibile virtualizzare qualsiasi tipi di file, librerie dinamiche (dll), oggetti ActiveX/COM (*. dll, *. ocx), file musicali e video (*. avi, MP3), file di testo (*. txt, *. doc), ecc.